Staszc, у вас свап, и никто из обычных коробочников вам не поможет, скорее всего.

Предполагаю дело не в коробке, она же раньше работала-то нормально с L3 турбо? Скорее всего коробка не видит информации из моторной кан-шины.
Нужны сваперы, имеющие опыт в трансляции пидов из ЭБУ мотора в ЭБУ коробки и наоборот.
С этим справится CANNY 7.2 или любой самодельный мост каншины.
И нужен Канхакер, это стоит все вместе 10-12 руб. максимум, по железу. Впрочем и сам Canny вроде бы как умеет читать hi-CAN в режиме канхакера.
Нужно вычитать все пиды стокового мотора в коробку и наоборот, и подменить пиды L5 в адреса и размерность. Написание проги и сто рублей может стоить, если "не найдется в колхозе тракториста".
Если хотите понять уровень сложности задачи - почитайте тут:
[Ссылки доступны только зарегистрированным пользователям. Регистрируйся тут...] (вперед и назад по теме). Человек справился сам, никто ему не помог, чуток на форуме Канни подсказали по самой проге.